Bioinformatique
Année du cours : années
Etablissement : Faculté de Gestion, Economie & Sciences Licences
Langue : Fr
Formation(s) dans laquelle/lesquelles le cours apparait :
- Licence Sciences de la Vie – Parcours Biotechnologies
Période : S5
Pour suivre ce cours, l’étudiant doit avoir des connassances en :
– Biochimie
– Biologie moléculaire
– Biotechnologies
– Connaissance du Web
A la fin du cours, l’étudiant devrait être capable d’appliquer des méthodes d’analyse bioinformatique permettant d’extraire les informations utiles d’une séquence d’un génome.
Intruduction : la bioinformatique, c’est quoi ?
Chapitre 1 : Les bases de données
Historique; Organisation; Systèmes d’interrogation dédiés (entrez, SRS, entrée SWISS-PROT)
Chapitre 2 : Design d’amorces
Méthodologie et logiciels (NetPrimet; Primer3; PerlPrimer)
Chapitre 3 : Analyses de séquences
Recherche de motifs dans les bases de données; Alignement de séquences par paires ou multiples, Notions de similitude; Systèmes d’interrogation dédiés (BLAST, CLUSTAL …)
Chapitre 4 : Prédiction et modélisation moléculaire
Utilisation de PDB (Protéine Data Bank); Structure 3D; Phylogénie moléculaire